Greifswald Botaniske Have blev etableret i sin oprindelige form i 1763 af Samuel Gustav Wilke (1736-1790) som en lægeplantehave mellem kollegiets bygninger (i dag: universitetets hovedbygning) og bymur udlagt. Med stigende byggeaktivitet i midten af 19-tallet og den tilhørende pladsmangel i bymidten blev haven i 1886 flyttet til sin nuværende placering på Münterstraße. Dengang som nu bruges den af universitetet til akademisk undervisning og af gæster som et sted at slappe af. Trods flytningen af den botaniske have bød den nye placering ikke på plads nok til et repræsentativt træbestand. I 1934 blev et separat arboret grundlagt på Friedrich-Ludwig-Jahn-Strasse.