Le jardin botanique de Greifswald a été créé dans sa forme originale en 1763 par Samuel Gustav Wilke (1736-1790) en tant que jardin de plantes médicinales entre le bâtiment du collège (aujourd'hui : bâtiment principal de l'université) et le mur de la ville aménagé. Avec l'augmentation de l'activité de construction au milieu du XIXe siècle et le manque d'espace associé dans le centre-ville, le jardin a été déplacé à son emplacement actuel sur la Münterstraße en 19. Alors comme aujourd'hui, il est utilisé par l'université pour l'enseignement académique et par les invités comme lieu de détente. Malgré le déplacement du jardin botanique, le nouvel emplacement n'offrait pas assez d'espace pour un stock représentatif d'arbres. En 1886, un arboretum séparé a été fondé sur la Friedrich-Ludwig-Jahn-Strasse.