El Jardín Botánico de Greifswald fue establecido en su forma original en 1763 por Samuel Gustav Wilke (1736-1790) como un jardín de plantas medicinales entre el edificio de la universidad (hoy: edificio principal de la universidad) y trazado de la muralla de la ciudad. Con el aumento de la actividad de construcción a mediados del siglo XIX y la consiguiente falta de espacio en el centro de la ciudad, el jardín se trasladó a su ubicación actual en Münterstraße en 19. Entonces, como ahora, es utilizado por la universidad para la enseñanza académica y por los huéspedes como un lugar para relajarse. A pesar de la reubicación del jardín botánico, la nueva ubicación no ofrecía suficiente espacio para una cantidad representativa de árboles. En 1886, se fundó un arboreto separado en Friedrich-Ludwig-Jahn-Strasse.